由于CD38抗原和ZAP-70蛋白表达与临床预后密切相关，所以在B-CLL的研究中检测这两个标记十分重要。其他一些标记，例如bcl-2、CD49d、CD71、CD、CXCR4、FCRL2、HLA-G和TCL1也开始被作为一些疾病的预后评价指标。
CD38
CD38抗原表达和缺少体细胞高突变有关，与这一观点相呼应的是CD38在表达IgD的B-CLL中较少见到，而在表达IgM的B-CLL中则表达较多见。而正常人一部分高突变的B细胞也正是IgD+CD38+的。
尽管对于CD38和突变状态的关联性还存在一定的争议。但对于CD38和预后差的关系还是得到了一致的认可。目前仍有一些学者则反对该观点，认为只是在疾病初期CD38表达和肿瘤团块存在关系，所以并不能作为独立预测指标。
有证据表明，即使CD38只表达在少量肿瘤细胞上，仍然提示预后差。所以CD38表达强度比阳性率更有意义。
然而，CD38的预后意义会随着其他的标记共表达而发生改变。事实上，CD38和CD31均弱表达的病人预后还是不错的，而那些CD38弱表达CD31高表达的患者则与CD38高表达患者预后类似。
CD38抗原是多态性的，其中有一种等位基因是第1内含子的胞嘧啶被鸟嘌呤所代替，这种等位基因与预后差、脾脏和淋巴结受累、发展为Richter综合征等有密切的关系。
奇怪的是，在家族性B-CLL中，CD38的表达与预后差似乎没有关系。
ZAP-70
在B-CLL患者中，2/3可检测到ZAP-70蛋白表达，该蛋白表达与体细胞缺少高突变、疾病进展快、总体生存时间短、诊断到采取治疗措施时间短、病情严重等相关。此外，ZAP-70表达和其他不良预后指标相关，例如：CD38表达、高血清LDH、高血清胸苷激酶、形态不典型、12三体、更短的淋巴细胞倍增时间、高血清CD23浓度、异常核型以及骨髓弥漫性浸润。
CD
CD作为白细胞相关性免疫球蛋白样受体中的一员，在B-CLL高危患者中表达缺失，其表达强度似乎与疾病的预后呈负相关。
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